La faune seychelloise ne comporte que peu de mammifères. Le soir, on pourra apercevoir et entendre les "roussettes", grandes chauve-souris, seul mammifère endémique des îles.
De nombreux reptiles peuplent les différentes îles. A l'exception des Galapagos, les tortues géantes ne se trouvent qu'aux Seychelles. La protection de la nature a permis de sauver cette espèce de la disparition. elle peuvent vivre jusqu'à 300 ans, peser 500 kg et mesurer 1,5 mètres de long et 1 mètre de haut. On peut aussi voir de très nombreux lézards. Seules quelques couleuvres inofensives se réchauffent au soleil.
Beaucoup d'espèces d'oiseaux ont été sauvées par l'isolement relatif des îles et par la politique de protection. On compte plus de 7 millions d'oiseaux appartenant à plus de 200 espèces dont beaucoup vivent uniquement sur ces îles.
Autour de Mahé et de Praslin, quatre réserves marines nationales protègent presque toutes les espèces de la faune marine tropicale de récif des Seychelles (poissons, coquillages, éponges, etc.). En 1996, les effets du courant marin El Niņo a fait augmenter la température de la mer au dela du supportable pour les coraux, ce qui a provoqué un désastre dans cette population. Les Quatre espèces de tortues de mer, endémiques aux Seychelles, tendent à se raréfier. Relativement nombreux il y a quelque temps, les crustacés et les mollusques ont tendance à disparaître, ce qui a incité le gouvernement à en interdire leur exploitation.
Les photos dont les commentaires sont de couleur rouge sont extraites du film "SEYCHELLES" de Claude PAVARD (Oasis Productions).
